ATOOK permet de saisir des pièces commerciales de vente et d'achat (devis, factures, etc.), des règlements pour ces pièces commerciales, d'envoyer des mails de relance client, puis d'exporter toutes les données comptables vers un logiciel de comptabilité compatible.
La gestion comptable dans ATOOK Bureau s'articule principalement autour des paramètres dans BASE > Comptabilité et des modules CLIENTS, et VENTES.